袋式除尘器在运行过程中，粉尘初层的形成对除尘效率的影响十分大，如若过度清灰，会破坏粉尘初层，使滤料间的孔隙变大，小颗粒容易透过滤料，从而降低除尘设备的除尘效果。
袋式除尘器的清灰工作原理：
含尘气体在引风机吸引力的作用下进入灰斗，经导流板后被均匀分配到各条滤袋上。粉尘被拦截在滤袋外表面，气体则穿过滤袋，经过净气室后外排。袋式除尘器捕集在滤袋外表面上的粉尘会导致滤袋透气性的减少，使除尘器的阻力不断增加，等到阻力达到设定植（差压控制）或是过滤的时间达到设定值（时间控制），通常处于关闭状态的脉冲阀在脉冲喷吹控制仪PLC脉冲喷吹控制下打开极短暂的一段时间（0.1s左右），高压气体瞬间从气包进入喷吹管，并高速从喷吹孔喷出。高速气流喷入滤袋是还会产生数倍于喷射气体的二次引流。
喷射气流与二次引流的共同作用使滤袋内侧的压力迅速升高，滤袋由原先内凹的形状变成外凸的形状，并在变形量达到大值时产生一个很大的反向加速度，吸附在滤袋上的粉尘主要在这反向加速度作用下，脱离滤袋表面，落入灰斗，除尘器的阻力随之下降。将粉尘从滤袋表面清理的过程称为清灰。清灰工作是一排一排进行的。脉冲阀每动作一次，一排滤袋就得到清灰。脉冲阀按照设定的时间间隔与顺序依次动作，直到完成一个循环。整台除尘器就完成了一个清灰周期。
袋式除尘器的常用的清灰方式：
常用的清灰方式主要有三种，即机械清灰、脉冲喷吹清灰和反吹风清灰。对于难于清理的粉尘，也可同时并用两种清灰方法也叫联合清灰，如采用反吹风和机械振动相结合清灰以及声波辅助清灰。
机械清灰是指利用机械振动或摇动悬吊滤袋的框架，使滤袋产生振动而清灰的方法;反吹风清灰是指利用与过滤气流相反的气流，使滤袋变形造成粉尘层脱落的一种清灰方式；
脉冲喷吹清灰是指利用压缩空气在极短暂的时间内高速喷入滤袋，同时诱导数倍于喷射气流的空气，形成空气波，使滤袋由袋口至底部产生急剧的膨胀和冲击振动，造成很强的清落积尘作用；联合清灰是指将两种清灰方式同时用在同一除尘器内，目的是加强清灰效果。
